Я решил проблему с ангаром и сохранениями! :-D
Итак: изначально был построен ангар, внутри него - СО2 скраббер, на входе - шлюз.
Потом был уничтожен шлюз. При этом скраббер просто пропал, а разрушение ангара приводило к ошибке сохранений.
Я построил новый шлюз, сохранился, загрузился - и скраббер снова возник на своём месте. Разрушил скраббер, затем ангар - и благополучно сохранился.
Проблема решилась, но мне кажется - что это баг. :-)